مؤسسه خط‌مشی خود را تلاش برای ارائه راهکارهای راهبردی و عملیاتی در حل چالش‌های ملی و دستیابی به توسعه همه‌جانبه و پایدار از طریق به‌کارگیری دانش ‌تخصصی و حرفه‌ای، شناخت اقلیم ایران و هم‌افزایی دانش و تجربیات موجود در کشور با بهره‌گیری از روش‌های جدید و مبتنی بر مشارکت، خلاقیت و تأمین منافع همه عوامل ذی‌نفع در کنار عمل صادقانه و خالصانه قرار داده است. دستیابی به تخصص حرفه‌ای و قابل طرح در سطح بین‌المللی همراه با حفظ اصول اخلاقی چشم‌اندازی است که مؤسسه برای تحقق آن تلاش می‌کند.

مؤسسه با شعار محوری پژوهش پیش‌نیاز تصمیم بر لزوم انجام مطالعات دقیق، جامع و تخصصی و به ‌دور از ملاحظات غیرحرفه‌ای قبل از هر اقدام عملی تأکید دارد.

مؤسسه دارای رتبه پایه سه در زمینه‌ شبکه‌های آبیاری و زهکشی، محیط زیست و آب فاضلاب از طرف معاونت برنامه‌ریزی و نظارت راهبردی رئیس جمهور، رتبه پایه سه حفاظت مهندسی و رودخانه، رتبه پایه دو محیط زیست و رتبه پایه دو تاسیسات آب و فاضلاب می‌باشد و تاکنون ضمن انجام پروژه‌های متعدد، موفق به تدوین و تألیف چهار کتاب، ارائه چندین مقاله و تهیه یک نشریه تخصصی شده است. برگزاری بیش از یکصد دوره آموزشی و کارگاه تخصصی به‌ویژه در زمینه مهندسی ارزش، مهندسی آب و مدیریت بحران از دیگر فعالیت‌های مؤسسه بوده است.